Results of Expasy Translation

Sus scrofa gap junction protein alpha 1 (GJA1), mRNA

>NM_001244212.1 Sus scrofa gap junction protein alpha 1 (GJA1), mRNA

Translate Tool – Results of translation

Open reading frames are highlighted in red. Please select one of the following frames – in the next page, you will be able to select your initiator and retrieve your amino acid sequence:

5’3′ Frame 1
T R Y Q H F S F I R G K E Stop G K Y Q T A A D F Stop T L N R Q V Stop V P E L A F S F Y F I L Stop G V

5’3′ Frame 2
R G I S T F L S L G G R S E E S T K Q Q Q T F K L Stop I D R S E C L N L L F H F T S S S E A C

5’3′ Frame 3
E V S A L F F H Stop G E G V R K V P N S S R L L N F K Stop T G L S A Stop T C F F I L L H P L R R A

3’5′ Frame 1
G T P Q R Met Stop N E K A S S G T Q T C L F K V Stop K S A A V W Y F P H S F P L Met K E K C Stop Y L

3’5′ Frame 2
A R L R G Stop S K Met K K Q V Q A L R P V Y L K F K S L L L F G T F L T P S P Stop Stop K K S A D T S

3’5′ Frame 3
H A S E D E V K Stop K S K F R H S D L S I Stop S L K V C C C L V L S S L L P P N E R K V L I P

DNA to Protein Translation

Protein sequence

Frame 1

I L L L G T A V E S A W G D E Q S A F R C N T Q Q P G C E N V C Y D K S F P I S H V R F W V L Q I I 50
F V S V P T L L Y L A H V F Y V M R K E * S R * K * R S L S T A L R S T A R * K C E G
Total length= 93

Map

1 A U C C U G C U C U U G G G C A C A G C U G U U G A G U C A G C C U G G G G U G A U G A G C A G U C U G C C U U U C G U 60
————————————————————

U A G G A C G A G A A C C C G U G U C G A C A A C U C A G U C G G A C C C C A C U A C U C G U C A G A C G G A A A G C A

I  L  L  L  G  T  A  V  E  S  A  W  G  D  E  Q  S  A  F  R
S  C  S  W  A  Q  L  L  S  Q  P  G  V  M  S  S  L  P  F  V
P  A  L  G  H  S  C  *  V  S  L  G  *  *  A  V  C  L  S  L
————————————————————

D  Q  E  Q  A  C  S  N  L  *  G  P  T  I  L  L  R  G  K  T
G  A  R  P  C  L  Q  Q  T  L  R  P  H  H  A  T  Q  R  E  N
R  S  K  P  V  A  T  S  D  A  Q  P  S  S  C  D  A  K  R  Q     61 U G U A A C A C U C A G C A A C C C G G U U G U G A A A A U G U C U G C U A U G A C A A A U C C U U C C C C A U C U C U 120
————————————————————

A C A U U G U G A G U C G U U G G G C C A A C A C U U U U A C A G A C G A U A C U G U U U A G G A A G G G G U A G A G A

C  N  T  Q  Q  P  G  C  E  N  V  C  Y  D  K  S  F  P  I  S
V  T  L  S  N  P  V  V  K  M  S  A  M  T  N  P  S  P  S  L
*  H  S  A  T  R  L  *  K  C  L  L  *  Q  I  L  P  H  L  S
————————————————————

T  V  S  L  L  G  T  T  F  I  D  A  I  V  F  G  E  G  D  R
Y  C  E  A  V  R  N  H  F  H  R  S  H  C  I  R  G  W  R  E
L  V  *  C  G  P  Q  S  F  T  Q  *  S  L  D  K  G  M  E  *    121 C A C G U G C G U U U C U G G G U C C U G C A G A U C A U A U U U G U G U C U G U U C C U A C A C U C U U G U A C C U G 180
————————————————————

G U G C A C G C A A A G A C C C A G G A C G U C U A G U A U A A A C A C A G A C A A G G A U G U G A G A A C A U G G A C

H  V  R  F  W  V  L  Q  I  I  F  V  S  V  P  T  L  L  Y  L
T  C  V  S  G  S  C  R  S  Y  L  C  L  F  L  H  S  C  T  W
R  A  F  L  G  P  A  D  H  I  C  V  C  S  Y  T  L  V  P  G
————————————————————

V  H  T  E  P  D  Q  L  D  Y  K  H  R  N  R  C  E  Q  V  Q
R  A  N  R  P  G  A  S  *  I  Q  T  Q  E  *  V  R  T  G  P
T  R  K  Q  T  R  C  I  M  N  T  D  T  G  V  S  K  Y  R  A    181 G C U C A U G U G U U C U A C G U G A U G C G A A A G G A A U A A A G C A G A U A G A A A U A A A G A A G U U U A A G U 240
————————————————————

C G A G U A C A C A A G A U G C A C U A C G C U U U C C U U A U U U C G U C U A U C U U U A U U U C U U C A A A U U C A

A  H  V  F  Y  V  M  R  K  E  *  S  R  *  K  *  R  S  L  S
L  M  C  S  T  *  C  E  R  N  K  A  D  R  N  K  E  V  *  V
S  C  V  L  R  D  A  K  G  I  K  Q  I  E  I  K  K  F  K  Y
————————————————————

S  M  H  E  V  H  H  S  L  F  L  A  S  L  F  L  S  T  *  T
E  H  T  R  R  S  A  F  P  I  F  C  I  S  I  F  F  N  L  Y
*  T  N  *  T  I  R  F  S  Y  L  L  Y  F  Y  L  L  K  L  V    241 A C G G C A U U G A G G A G C A C G G C A A G G U G A A A A U G C G A G G G G G 280
—————————————-

U G C C G U A A C U C C U C G U G C C G U U C C A C U U U U A C G C U C C C C C

T  A  L  R  S  T  A  R  *  K  C  E  G
R  H  *  G  A  R  Q  G  E  N  A  R  G
G  I  E  E  H  G  K  V  K  M  R  G
—————————————-

R  C  Q  P  A  R  C  P  S  F  A  L  P
P  M  S  S  C  P  L  T  F  I  R  P  P
A  N  L  L  V  A  L  H  F

MBOSS TRANSEQ

Sus scrofa gap junction protein alpha 1 (GJA1), mRNA

>NM_001244212.1 Sus scrofa gap junction protein alpha 1 (GJA1), mRNA

A C G A G G T A T C A G C A C T T T T C T T T C A T T A G G G G G A A G G A G T G A G G A A A G T A C C A A A C A G C A G C A G A C T T T T

A A A C T T T A A A T A G A C A G G T C T G A G T G C C T G A A C T T G C T T T T T C A T T T T A C T T C A T C C T C T G A G G C G T G C C

T A C T T C A C T T C T T T T A A G G G A A A G A G T A G T G T C C G G G C A A C A T G G G T G A C T G G A G T G C C T T A G G C A A A C T

C C T T G A C A A G G T T C A A G C C T A T T C C A C C G C T GG A G G G A A G G T G T G G C T G T C A G T C C T T T T C A T T T T C C G A

A T C C T G C T C T T G G G C A C A G C T G T T G A G T C A G C C T G G G G T G A T G A G C A G T C T G C C T T T C G T T G T A A C A C T C

A G C A A C C C G G T T G T G A A A A T G T C T G C T A T G A C A A A T C C T T C C C C A T C T C T C A C G T G C G T T T C T G G G T C C T

G C A G A T C A T A T T T G T G T C T G T T C C T A C A C T C T T G T A C C T G G C T C A T G T G T T C T A C G T G A T G C G A A A G G A A

G A G A A A C T G A A C A A G A A A G A G G A G G A A C T C A A A G T T G C C C A A A C T G A C G G T G T C A A C G T G G A G A T G C A C T

T A A A G C A G A T A G A A A T A A A G A A G T T T A A G T A C G G C A T T G A G G A G C A C G G C A A G G T G A A A A T G C G A G G G G G

C T T G C T G C G A A C C T A C A T C A T C A G T A T C C T C T T C A A G T C T G T C T T C G A G G T G G C C T T C T T G C T G A T C C A A

T G G T A C A T C T A T G G A T T C A G C C T G A G T G C T G T T T A C A C T T G C A A A A G A G A T C C C T G C C C G C A C C A G G T G G

A C T G T T T C C T C T C T C G T C C C A C G G A G A A A A C C A T C T T C A T C A T C T T C A T G C T G G T C G T A T C C T T G G T G T C

T C T C G C C T T G A A C A T C A T C G A A C T C T T C T A T G T C T T C T T C A A G G G T G T T A A G G A T C G T G T G A A G G G A A A G

A G T G A T C C T T A C C A C G C C A C C A C C G G T C C A C T G A G C C C C T C C A A A G A C T G T G G A T C T C C A A A A T A C G C T T

A T T T C A A T G G C T G C T C C T C A C C A A C T G C T C C G C T C T C A C C C A T G T C C C C T C C C G G A T A C A A G C T G G T T A C

C G G A G A C A G A A A C A A T T C T T C C T G C C G C A A T T A C A A C A A A C A A G C G A G T G A G C A A A A C T G G G C T A A T T A C

A G T G C C G A G C A G A A T C G A A T G G G G C A G G C A G G A A G C A C C A T C T C T A A C T C C C A T G C AC A G C C T T T T G A T T

T C C C C G A T G A C A A C C A G A A T T C T A A A A A A C T C G A T G C T G G C C A T G A A C T C C A G C C T C T A G C C A T T G T G G A

C C A G C G G C C T T C C A G C A G A G C C A G C A G T C G C G C C A G C A G C C G A C C T C G G C C T G A T G A C C T G G A G A T C T A G

A G C C A A T C T T G A G A A C A T C A A G A T T C C A C T C A G T T G T G G A G A A G A A A A A G G T G C T A T A G A A A G T G C A C C T

T A G G T G T T C A T T T T T T T T C C A G T G G A G G T G G T A C T C A A C A G C C T T G T C A C A A G G C T T A G A A A A C A C A A A G

A C A T T A G A A T A C C T G G T T C A T A G G G G G T G T T A G G G A T A G G T G G G T G G A G A G G G A G G G G A T G A G G G A G G T A

C A G G T T G G T A T T T A A T G T A G T T G A C T T A A A G A A C T T A A G T T C T A A A T A A C A G T T G C A T T A G G T G A T CT A T

A G G T A A G G G C T T T T T C T C C T C C C C A T A C C C T T A A G A A T A G C T C T G T G T A T G T G A A A G A G T G G G T G A T G T T

T T T G G C T A A A T A C T T T T T T C A T T T T A C C A A G A A A C T G A A A T A A C T T T G G C C A G G A G A A A A T A C T T C C T G A

A C A T T T T A T T T C T C T T T T T C A A G A A A A A G A C A G A G G A T T T T C C T T G A G T C C C T G C T A A A A C A T T C C A T T G

T T A A A A T T T G C A C T T T G A A G G T A A G C T T T T T A G G C C T G A C C C T C C A G G T G T C A A T G G A C T T G T G C T A C T A

T A T T T T T T A A T C T T G G T A T C A G T T A A A A G T T C A G A C A A G G C C C A C A G A A A A A G A T G T T C C A A G C A T T T G C

A A A T C T C A G C C G G T T A C A C A A A C C T T C T T T T T T A C A T C C A C T T G C T T A T A T T A T T A C C A T C A C T T T A C G T

C A T T C C T C A A C T A C T A T C A C A T C C A T T T A A T G A T T T C T G T A A A C A T T T T T T A A A C A G T T A G G A T G T C A C T

T A A C A T T T T T T G A G T T A G A G T C A G G G A A G C A A G C C A T G CT C A A T A T T T A A C A A T C A C T T G T A T G T A T A T G

T T T G T G G A A G AG T G T G T T T T A T T T G T C A T G T A T T G G T A C A A G C A GA T G C A G T A T A A A C T C A C A A A C A C A G

A T T T G A A A A T A A T G C A C A C A G T G T T C A A A T T T G A A C T T T T C T C A T G G A T T T C A T G G T A TG G G C CA A C A T G

G T G T T T A C A T T A T A T A A T T C C T G C T G T G C A A G T A A A G C A C A C T T T T T T T T C C C T A A A A T T T T T T T T C C C C

A T G T A T C C T A T T A T G G A T A C T A G T T T T G T T A A T T A T G A T T C T T T T T TT T C T C T T T T C T T T T T T T T T A G A A

T A T A G C A G T T A A T G C T A T T G C T G A A A T G A A T G A T T T T T T T T T C T G A A A T A T A A T C A T T G A T G C T T G A A T G

A T A G A A T T T T A GT A C T G T A A A C A G G C T T T A G T A A T T A A T G T G A G A G A C T T A G A A G A A A T G C T T A G A A T G G

A C T A T T G A G T G T G C C T A A A T G A A T T C T G C A G T A A C T G G T A T T C T T G G T T T T G T G C T A C T T A A T A C A C A T T

A A T T C A G A A A C T G T A T T C T G T T A T G A G T T T G A C A G T C T T T T G G A G C A A C C A A C A A C T T T G A T G T T T GC A C

T A A G A T T T T A T T T G G A A TG C A A G A G A G G T T G A A A GA G C T T T C A G T A G T A C A C A T G T A A C T A A T T T A T T T G

A A A T C T G T C C T A A A G A A A T C T A C C A G T T T G T T C A A A T G C C T T T T T A A A A T T C A T C A C A G A T A A T T A G T G A

A A A C G C A G A G T A T C G T A C T T T T C T T C T T G CA T G T C A A CA A C A T A A A CA G T T T T G T A C A A T G A G A A A T A C T

A A T T T G T T T G A C A T T C C A T A T T A A A C T A C T G T C A T G T T C A G C T T C A T T G C A T G T A A T G T A G A C T A G T C C A

T C A G A T C A T G T G T T T C T G G A G A G T G T T C T T T A T T C A A T A A A G T T T T A A T T T A G T A T A A A G A G A G C C T C T A

A A A A A A A A A A A A A A A A A

Avatar
Author

Hifza is a student of bioinformatics. She is a research student and working on cancer.

1 Comment

  1. Avatar

    g c c c c t g c c c g g c c t g c c t c t c a c c c c c t g c a g a t g g g g c c c t g c t c ct a t g a g a t c a a g c a g t t c c t g g a c t g c t c c a c c a c t c a g a g c g a c c t a a c c c t g t g t g a g g g c t t c a g c g a g g c c c t c a a a c a g t g c a a a t a c a a t c a c g

Write A Comment

Pin It